医院肛肠科依据二级中医肛肠医院标准创建，经滕州市卫健局验收合格，枣庄市卫健局备案并于2015年11月正式授牌为滕州市肛肠病医院（二级专科）。现已成为枣庄乃至鲁南地区较有影响力的肛肠病专科医院。科室现拥有医护人员30余人，拥有中、高级职称15余人，本科及以上学历20余人，由山东省肛肠病医院知名专家来院坐诊手术。目前设置床位60张，拥有全自动电脑诊断治疗系统、DR排便造影及后处理系统、电子直肠镜检查治疗系统，爱尔博电频系统及雾化熏洗室等，拥有目前最完善的手术室及相关配套设施。科室以国内、外肛肠专业先进理论为依托，采用西医微创技术为主兼顾中西医结合方法治疗：内痔、外痔、混合痔、肛裂、脱肛、肛瘘、肛周脓肿、肛门直肠狭窄、肛周皮肤病、肠病、慢性腹泻、肠易激综合征、便秘、直肠息肉、直肠肿瘤等肛肠相关疾病。